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Título : Filogenia molecular de las orquídeas del género Dracula en el Ecuador, utilizando ITS como marcador molecular.
Autor : Moreno Palacios, Mariela Micaela
Director(es): Recalde Moreno, Celso Guillermo
Tribunal (Tesis): Calderón Tapia, Cristina Gabriela
Palabras claves : BIOTECNOLOGÍA;BIOLOGÍA MOLECULAR;ORQUIDEA (Dracula);ESPACIADOR TRANSCRITO INTERNO (ITS);REACCIÓN EN CADENA DE POLIMERASA (PCR);CLADOGRAMA
Fecha de publicación : ago-2018
Editorial : Escuela Superior Politécnica de Chimborazo
Citación : Moreno Palacios, Mariela Micaela. (2018). Filogenia molecular de las orquídeas del género Dracula en el Ecuador, utilizando ITS como marcador molecular. Escuela Superior Politécnica de Chimborazo. Riobamba.
Identificador : UDCTFC;236T0400
Abstract : The objetive was to stablish the molecular phylogeny of the Dracula orchids kind in Ecuador, by using the Internal Trascribed Spacer (ITS) as a molecular marker; for which it has been recollect 54 or 55 species described in the country in a total of 108 samples from collectors and orchidariums located in the Carchi and Pichincha province. The molecular analysis was made to avoid any classification problems for these gender and artificial hybrids confuse with new species, the extraction of the DNA was made by a chemical protocol of Doyle & Doyle, subsequently the molecular marker samples the ITS1 for the Fordware chain and the ITS4 for the reverse chain were amplified, in horizontal electrophoresis through the polymerase chain reaction technique (PCR) conventional for its further sequencing in Macrogen, the generation of cladograms ware made with the MEGA 7 software. Two kind of species were taken, the Masdevallia and Diodopnosis erinacea species as external groups for rooting the tree. The used of the marker ITS leave a more clear understanding of the evolution of this gender and many others species inside of it, the formation of clades and the absence of hybrids, despite this, as a universal marker it could generate mistakes on the cladograms the ones that show many sections of subdivided ranges and to be this the first study to apply the ITS on these type of orchids, the results cannot be compare with the defined cladograms by this marker. Its recommend to investigate new regions of chloroplastic and nuclear DNA to resolve the controversy that presents the outdated classification of the gender.
Resumen : El objetivo fue establecer la filogenia molecular de las orquídeas del género Dracula en el Ecuador, utilizando el Espaciador Transcrito Interno (ITS) como marcador molecular; para lo cual se recolectaron 54 de las 55 especies descritas en el país en un total de 108 muestras de coleccionistas y orquidearios ubicados en las provincias de Carchi y Pichincha. El análisis molecular se efectuó para abordar problemas de clasificación de este género e híbridos artificiales confundidos como nuevas especies, la extracción de ADN se lo hizo mediante el protocolo químico de Doyle & Doyle, posteriormente se amplificaron las muestras con el marcador molecular ITS1 para la cadena Fordware e ITS4 para la cadena Reverse, en electroforesis horizontal mediante la técnica de Reacción en cadena de polimerasa (PCR) convencional para su posterior secuenciación en Macrogen. La generación de cladogramas se trabajó con el software MEGA 7. Se tomaron dos especies del género Masdevallia y la especie Diodonopsis erinacea como grupos externos para el enraizamiento del árbol. La utilización del marcador ITS nos deja más claro el entender la evolución del género y de varias especies dentro de él, la formación de clados y la ausencia de híbridos, sin embargo, ya que es un marcador universal puede generar errores en los cladogramas los cuales exhibieron varias secciones de rama subdivididas y al ser este el primer estudio que aplica ITS en este tipo de orquídeas, no se puede comparar resultados con cladogramas definidos por este marcador. Se recomienda investigar nuevas regiones de ADN cloroplástico y nuclear para poder resolver la controversia que presenta la clasificación desactualizada del género.
URI : http://dspace.espoch.edu.ec/handle/123456789/10541
Aparece en las colecciones: Ingeniería en Biotecnología Ambiental

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